Gadgetshowto
Vědci z Googlu a Janelia Research Campus z Lékařského institutu Howarda Hughese vytvořili sofistikovanou 3D neurální reprezentaci mozku ovocné mušky. 3D mapa se nazývá konektom a obsahuje kolem 25 000 neuronů spolu s asi 20 miliony synapsí.
Vědci tvrdí, že jejich prací je největší dosud vytvořený konektom na synaptické úrovni. Proces zahrnoval zobrazování, rekonstrukci a korekturu 3D modelu pro přesnost.
Mozková tkáň mouchy byla rozdělena na samostatné desky o tloušťce 20 mikronů. Desky byly zobrazeny v rozlišení voxelů 8x8x8nm3 pomocí zaostřeného elektronového mikroskopu se skenováním iontovým paprskem.
Tým Google rekonstruoval celý hemibrain pomocí techniky zvané Flood-Filling Networks (FFN). „FFN byly první technologií automatizované segmentace, která přinesla rekonstrukce, které byly dostatečně přesné, aby umožnily pokračování celého projektu hemibrain.“
Google pomocí FFN dokázal ve srovnání s lidskými korektory zkrátit čas nutný ke korektuře. Blog Google konstatuje, že korektury pro člověka by trvaly desítky milionů hodin, zatímco FFN jej dosahuje za stovky tisíc lidských hodin.
Týmu trvalo dva roky, než zkontroloval svá zjištění, a to i za pomoci FFN, což znamená složitost. "Použili jsme řadu algoritmů strojového učení a více než 50 osoboroků úsilí na korektury během 2 kalendářních let, abychom extrahovali řadu kompaktnějších a užitečných reprezentací, jako jsou kostry neuronů, umístění synapsí a grafy připojení.", napsali vědci v článku.
Projekt se snaží být veřejným zdrojem pro vědce. Výzkumný tým také vydal několik nástrojů, které můžete použít pro vizualizaci a analýzu. Více informací o projektu se můžete dozvědět v průzkumné práci a zde můžete procházet data.
